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首都醫(yī)科大學附屬北京天壇醫(yī)院
北京天壇醫(yī)院是一所以神經(jīng)外科為先導的三級甲等綜合性教學醫(yī)院，是世界三大神經(jīng)外科研究中心之一。國家神經(jīng)系統(tǒng)疾病臨床醫(yī)學研究中心便設(shè)在該院，是國內(nèi)規(guī)模最大的神經(jīng)系統(tǒng)疾病領(lǐng)域臨床醫(yī)學研究平臺。
2018 年，九芝堂美科與北京天壇醫(yī)院簽訂《干細胞臨床研究基地共建協(xié)議》。雙方將持續(xù)推進干細胞臨床前研究工作。
2021 年 1 月 12 日，我國首個使用進口干細胞治療缺血性卒中的 Ⅰ/Ⅱa 期臨床試驗(ASSIST)正式啟動。這是國家把干細胞作為藥物監(jiān)管以來，第一個按照新版《藥物臨床試驗質(zhì)量管理規(guī)范》進行的干細胞治療腦血管疾病的臨床試驗，這次試驗對于干細胞進入腦血管疾病領(lǐng)域的臨床應用和干細胞應用整個管理體系的改變都非常重要。
首都醫(yī)科大學附屬北京安定醫(yī)院
首都醫(yī)科大學附屬北京安定醫(yī)院始建于1908年，現(xiàn)為市屬精神衛(wèi)生醫(yī)療機構(gòu)暨三級甲等?？漆t(yī)院，承擔著醫(yī)療、教學、科研、預防、社會服務和對外交流等任務。首都醫(yī)科大學附屬北京安定醫(yī)院在普通精神科的基礎(chǔ)上，發(fā)展出抑郁癥治療中心、老年精神科、兒童精神科、中西醫(yī)結(jié)合精神科、臨床心理科、司法鑒定科、精神康復科等特色化診療團隊，且多年來承擔北京市唯一24小時精神科急診任務。
廣州醫(yī)科大學附屬第一醫(yī)院
廣州醫(yī)科大學附屬第一醫(yī)院是一所集醫(yī)療、教學、科研、保健、康復、院前急救于一體的大型三級甲等醫(yī)院，也是廣州呼吸疾病研究所、廣州骨科研究所、廣州泌尿外科研究所、廣州醫(yī)科大學中西醫(yī)結(jié)合研究所所在醫(yī)院，也是國家首批13個國家臨床醫(yī)學研究中心之一。
2020 年，九芝堂美科與廣州醫(yī)科大學附屬第一醫(yī)院簽訂《科研合作協(xié)議》。雙方共同開展骨髓間充質(zhì)干細胞治療肺部疾病的有效性研究。 2023年6月，九芝堂美科第二款干細胞新藥臨床試驗獲得批準（受理號：CXSL2300202），適應癥為自身免疫性肺泡蛋白沉積癥(aPAP)。 2023年11月1日，該項臨床試驗正式啟動，九芝堂美科正在與廣州醫(yī)科大學附屬第一醫(yī)院合作開展hBMMSC治療自身免疫性肺泡蛋白沉積癥(aPAP)的 Ⅱa 期臨床試驗。
